Dnia 2 czerwca 2019 doszło do pożaru na poddaszu zakrystii naszego kościoła. Informacja o zagrożeniu zniszczenia świątyni wybudowanej ponad 620 temu lat szybko pojawiła się w przestrzeni medialnej. Wiadomość ta napełniła smutkiem nie tylko parafian, którzy od lat z wielkim wysiłkiem przywracają pierwotne piękno tej gotyckiej, gdańskiej świątyni, ale poruszyła także biskupów, kapłanów i wiernych Archidiecezji Gdańskiej oraz ludzi dobrej woli, ceniących historię i piękno Pomorza.
Dzięki szybkiej reakcji służb udało się uratować kościół. Ogień gasiło prawie 30 zastępów Państwowej Straży Pożarnej oraz Ochotniczych Straży Pożarnych, a w akcji ratunkowej uczestniczyło około 100 strażaków, którzy z ogromnym profesjonalizmem, a także szacunkiem dla świętości miejsca, wykonywali akcję gaśniczą, porządkową i zabezpieczającą. Pracę strażaków wspierali również parafianie i ludzie dobrej woli, którzy przez wiele godzin pomagali w zabezpieczeniu zabytkowych elementów wyposażenia kościoła.